在同種類型的廢水中，為何使用了同樣的除磷劑藥劑，使用同樣的工藝，投加相同量的藥劑，出水的含磷量一個能夠達標一個卻不能呢？這就要追溯到投加除磷劑的方法及用量了。
有研究表明，污水中各種形態的磷并不是相等的，以生活污水尾水為例，溶解性總磷酸鹽＞溶解性正磷酸鹽＞顆粒態磷含量＞其他溶解磷，但是由于水的差異，總磷的相同也會導致不同廢水當中的含磷比例有所差異。
一般除磷劑使用時可以直接直接投加或者稀釋后投加，把污水的酸堿值調至正常的數值上來。然后把除磷劑投入廢水后，藥劑和污水充分混合后會發生化學反應，有害物會以沉淀或者氣泡的形式被排出水體。一般的除磷劑添加量為廢水量的萬分之一到千分之一，在估算好污水量后，可算出污水量的萬分之一到千分之一之間的量。如果是稀釋后投加，一般稀釋三到十倍。
掌握科學的投藥方法可以使效果達到最佳的狀態，這樣既可以節約藥劑用量和成本，有可以有效提高除磷的效果。
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